Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC172P0C7W6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC172P0C7W6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC172P0C7W6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC172P0C7W6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC172P0C7W6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC172P0C7W6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC172P0C7W6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC172P0C7W6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC172P0C7W6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC172P0C7W6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC172P0C7W6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC172P0C7W6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC172P0C7W6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC172P0C7W6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC172P0C7W6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC172P0C7W6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC172P0C7W6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC172P0C7W6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC172P0C7W6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC172P0C7W6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC172P0C7W6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC172P0C7W6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC172P0C7W6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC172P0C7W6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC172P0C7W6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC172P0C7W6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC172P0C7W6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC172P0C7W6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC172P0C7W6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC172P0C7W6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC172P0C7W6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC172P0C7W6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC172P0C7W6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC172P0C7W6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC172P0C7W6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC172P0C7W6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC172P0C7W6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC172P0C7W6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC172P0C7W6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC172P0C7W6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC172P0C7W6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC172P0C7W6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC172P0C7W6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC172P0C7W6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC172P0C7W6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC172P0C7W6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC172P0C7W6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC172P0C7W6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC172P0C7W6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC172P0C7W6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC172P0C7W6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC172P0C7W6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC172P0C7W6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC172P0C7W6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC172P0C7W6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC172P0C7W6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC172P0C7W6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC172P0C7W6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC172P0C7W6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC172P0C7W6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC172P0C7W6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC172P0C7W6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms