Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgb1P09055 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgb1P09055 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itgb1P09055 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itgb1P09055 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itgb1P09055 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itgb1P09055 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb1P09055 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb1P09055 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb1P09055 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itgb1P09055 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itgb1P09055 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itgb1P09055 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itgb1P09055 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itgb1P09055 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itgb1P09055 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itgb1P09055 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb1P09055 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb1P09055 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb1P09055 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb1P09055 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb1P09055 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb1P09055 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itgb1P09055 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itgb1P09055 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itgb1P09055 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itgb1P09055 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb1P09055 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb1P09055 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb1P09055 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb1P09055 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Itgb1P09055 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb1P09055 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Itgb1P09055 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb1P09055 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb1P09055 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb1P09055 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb1P09055 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb1P09055 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb1P09055 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb1P09055 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb1P09055 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb1P09055 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb1P09055 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb1P09055 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb1P09055 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb1P09055 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb1P09055 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb1P09055 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb1P09055 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb1P09055 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb1P09055 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb1P09055 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb1P09055 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb1P09055 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb1P09055 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb1P09055 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms