Protein–RNA interactions for Protein: P09041

Pgk2, Phosphoglycerate kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgk2P09041 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pgk2P09041 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pgk2P09041 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pgk2P09041 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pgk2P09041 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pgk2P09041 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pgk2P09041 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pgk2P09041 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pgk2P09041 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pgk2P09041 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pgk2P09041 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pgk2P09041 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pgk2P09041 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pgk2P09041 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pgk2P09041 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Pgk2P09041 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pgk2P09041 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pgk2P09041 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pgk2P09041 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pgk2P09041 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pgk2P09041 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pgk2P09041 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pgk2P09041 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Pgk2P09041 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pgk2P09041 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pgk2P09041 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pgk2P09041 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pgk2P09041 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pgk2P09041 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pgk2P09041 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pgk2P09041 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pgk2P09041 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pgk2P09041 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pgk2P09041 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pgk2P09041 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pgk2P09041 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pgk2P09041 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pgk2P09041 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pgk2P09041 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pgk2P09041 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pgk2P09041 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pgk2P09041 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pgk2P09041 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pgk2P09041 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pgk2P09041 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pgk2P09041 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pgk2P09041 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pgk2P09041 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pgk2P09041 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pgk2P09041 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Pgk2P09041 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pgk2P09041 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pgk2P09041 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pgk2P09041 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pgk2P09041 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pgk2P09041 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pgk2P09041 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pgk2P09041 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pgk2P09041 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pgk2P09041 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pgk2P09041 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pgk2P09041 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pgk2P09041 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pgk2P09041 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pgk2P09041 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pgk2P09041 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pgk2P09041 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pgk2P09041 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pgk2P09041 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pgk2P09041 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pgk2P09041 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pgk2P09041 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pgk2P09041 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pgk2P09041 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pgk2P09041 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pgk2P09041 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pgk2P09041 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pgk2P09041 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pgk2P09041 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pgk2P09041 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pgk2P09041 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pgk2P09041 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pgk2P09041 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pgk2P09041 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pgk2P09041 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pgk2P09041 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pgk2P09041 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pgk2P09041 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pgk2P09041 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pgk2P09041 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pgk2P09041 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pgk2P09041 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pgk2P09041 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pgk2P09041 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pgk2P09041 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pgk2P09041 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pgk2P09041 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pgk2P09041 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pgk2P09041 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pgk2P09041 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132 ms