Protein–RNA interactions for Protein: P09012

SNRPA, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPAP09012 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRPAP09012 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRPAP09012 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRPAP09012 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRPAP09012 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRPAP09012 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRPAP09012 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNRPAP09012 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRPAP09012 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms