Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PKHD1P08F94 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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