Protein–RNA interactions for Protein: P08247

SYP, Synaptophysin, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPP08247 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYPP08247 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYPP08247 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYPP08247 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYPP08247 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYPP08247 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYPP08247 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYPP08247 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYPP08247 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SYPP08247 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYPP08247 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYPP08247 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYPP08247 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYPP08247 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYPP08247 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYPP08247 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYPP08247 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYPP08247 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYPP08247 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYPP08247 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYPP08247 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYPP08247 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYPP08247 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYPP08247 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYPP08247 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYPP08247 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYPP08247 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYPP08247 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYPP08247 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYPP08247 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYPP08247 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SYPP08247 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYPP08247 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYPP08247 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYPP08247 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYPP08247 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYPP08247 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYPP08247 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYPP08247 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYPP08247 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYPP08247 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYPP08247 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYPP08247 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYPP08247 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SYPP08247 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYPP08247 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYPP08247 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYPP08247 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYPP08247 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYPP08247 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYPP08247 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYPP08247 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYPP08247 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYPP08247 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYPP08247 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYPP08247 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYPP08247 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYPP08247 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SYPP08247 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYPP08247 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYPP08247 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYPP08247 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYPP08247 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYPP08247 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYPP08247 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYPP08247 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYPP08247 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SYPP08247 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYPP08247 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYPP08247 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYPP08247 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYPP08247 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYPP08247 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYPP08247 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYPP08247 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYPP08247 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SYPP08247 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYPP08247 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYPP08247 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYPP08247 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYPP08247 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYPP08247 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYPP08247 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYPP08247 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYPP08247 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYPP08247 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SYPP08247 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYPP08247 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYPP08247 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYPP08247 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYPP08247 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYPP08247 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYPP08247 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYPP08247 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYPP08247 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYPP08247 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYPP08247 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYPP08247 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYPP08247 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYPP08247 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms