Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spta1P08032 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spta1P08032 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spta1P08032 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spta1P08032 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spta1P08032 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spta1P08032 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spta1P08032 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spta1P08032 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Spta1P08032 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spta1P08032 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spta1P08032 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spta1P08032 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spta1P08032 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spta1P08032 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spta1P08032 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spta1P08032 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spta1P08032 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spta1P08032 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spta1P08032 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spta1P08032 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spta1P08032 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spta1P08032 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Spta1P08032 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spta1P08032 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spta1P08032 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spta1P08032 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spta1P08032 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spta1P08032 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spta1P08032 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spta1P08032 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spta1P08032 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Spta1P08032 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spta1P08032 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spta1P08032 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Spta1P08032 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spta1P08032 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spta1P08032 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spta1P08032 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spta1P08032 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spta1P08032 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spta1P08032 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Spta1P08032 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spta1P08032 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Spta1P08032 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spta1P08032 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spta1P08032 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Spta1P08032 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spta1P08032 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spta1P08032 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spta1P08032 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spta1P08032 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spta1P08032 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spta1P08032 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spta1P08032 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spta1P08032 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spta1P08032 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Spta1P08032 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spta1P08032 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spta1P08032 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Spta1P08032 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spta1P08032 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spta1P08032 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spta1P08032 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Spta1P08032 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spta1P08032 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spta1P08032 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spta1P08032 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spta1P08032 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spta1P08032 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spta1P08032 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spta1P08032 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spta1P08032 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Spta1P08032 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spta1P08032 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Spta1P08032 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spta1P08032 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.6 ms