Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APODP05090 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APODP05090 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APODP05090 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APODP05090 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APODP05090 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APODP05090 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APODP05090 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APODP05090 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APODP05090 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APODP05090 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APODP05090 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APODP05090 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APODP05090 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APODP05090 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APODP05090 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APODP05090 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APODP05090 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
APODP05090 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APODP05090 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APODP05090 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APODP05090 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APODP05090 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APODP05090 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APODP05090 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APODP05090 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APODP05090 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APODP05090 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APODP05090 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APODP05090 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APODP05090 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APODP05090 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
APODP05090 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APODP05090 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APODP05090 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APODP05090 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APODP05090 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APODP05090 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APODP05090 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
APODP05090 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
APODP05090 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
APODP05090 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
APODP05090 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
APODP05090 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APODP05090 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APODP05090 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APODP05090 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APODP05090 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APODP05090 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APODP05090 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APODP05090 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APODP05090 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APODP05090 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APODP05090 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APODP05090 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APODP05090 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APODP05090 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APODP05090 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APODP05090 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APODP05090 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APODP05090 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APODP05090 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APODP05090 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APODP05090 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APODP05090 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
APODP05090 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APODP05090 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
APODP05090 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APODP05090 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APODP05090 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APODP05090 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APODP05090 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APODP05090 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APODP05090 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APODP05090 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APODP05090 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APODP05090 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APODP05090 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APODP05090 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APODP05090 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APODP05090 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APODP05090 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
APODP05090 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APODP05090 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APODP05090 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APODP05090 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APODP05090 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
APODP05090 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
APODP05090 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APODP05090 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APODP05090 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
APODP05090 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APODP05090 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APODP05090 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APODP05090 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APODP05090 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APODP05090 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APODP05090 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APODP05090 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APODP05090 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms