Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TK1P04183 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TK1P04183 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TK1P04183 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TK1P04183 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TK1P04183 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TK1P04183 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TK1P04183 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TK1P04183 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TK1P04183 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TK1P04183 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TK1P04183 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TK1P04183 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TK1P04183 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TK1P04183 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TK1P04183 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TK1P04183 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TK1P04183 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TK1P04183 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TK1P04183 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TK1P04183 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TK1P04183 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TK1P04183 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TK1P04183 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TK1P04183 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TK1P04183 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TK1P04183 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TK1P04183 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TK1P04183 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TK1P04183 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TK1P04183 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TK1P04183 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TK1P04183 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TK1P04183 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TK1P04183 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TK1P04183 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TK1P04183 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TK1P04183 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TK1P04183 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TK1P04183 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TK1P04183 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TK1P04183 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TK1P04183 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TK1P04183 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TK1P04183 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TK1P04183 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TK1P04183 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TK1P04183 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TK1P04183 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TK1P04183 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TK1P04183 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TK1P04183 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TK1P04183 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TK1P04183 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TK1P04183 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TK1P04183 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TK1P04183 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TK1P04183 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TK1P04183 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TK1P04183 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TK1P04183 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TK1P04183 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TK1P04183 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TK1P04183 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TK1P04183 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TK1P04183 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TK1P04183 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TK1P04183 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TK1P04183 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TK1P04183 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TK1P04183 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TK1P04183 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TK1P04183 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TK1P04183 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TK1P04183 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TK1P04183 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TK1P04183 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TK1P04183 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TK1P04183 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TK1P04183 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TK1P04183 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TK1P04183 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TK1P04183 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TK1P04183 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TK1P04183 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TK1P04183 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TK1P04183 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TK1P04183 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TK1P04183 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TK1P04183 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TK1P04183 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TK1P04183 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TK1P04183 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TK1P04183 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TK1P04183 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TK1P04183 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TK1P04183 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TK1P04183 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TK1P04183 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TK1P04183 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms