Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMNAP02545 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMNAP02545 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMNAP02545 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMNAP02545 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMNAP02545 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMNAP02545 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMNAP02545 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LMNAP02545 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMNAP02545 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMNAP02545 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMNAP02545 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMNAP02545 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMNAP02545 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMNAP02545 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMNAP02545 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMNAP02545 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMNAP02545 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMNAP02545 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMNAP02545 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMNAP02545 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMNAP02545 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMNAP02545 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMNAP02545 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMNAP02545 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMNAP02545 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMNAP02545 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LMNAP02545 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMNAP02545 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMNAP02545 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMNAP02545 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LMNAP02545 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LMNAP02545 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMNAP02545 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMNAP02545 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNAP02545 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNAP02545 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNAP02545 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNAP02545 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNAP02545 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNAP02545 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNAP02545 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNAP02545 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMNAP02545 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LMNAP02545 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LMNAP02545 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LMNAP02545 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LMNAP02545 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LMNAP02545 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LMNAP02545 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMNAP02545 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
LMNAP02545 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMNAP02545 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMNAP02545 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LMNAP02545 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LMNAP02545 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMNAP02545 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNAP02545 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNAP02545 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNAP02545 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNAP02545 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNAP02545 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNAP02545 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNAP02545 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNAP02545 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNAP02545 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMNAP02545 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMNAP02545 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMNAP02545 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMNAP02545 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMNAP02545 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMNAP02545 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMNAP02545 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMNAP02545 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMNAP02545 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMNAP02545 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LMNAP02545 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMNAP02545 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LMNAP02545 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMNAP02545 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LMNAP02545 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMNAP02545 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMNAP02545 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMNAP02545 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMNAP02545 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMNAP02545 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNAP02545 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNAP02545 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNAP02545 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNAP02545 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNAP02545 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNAP02545 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNAP02545 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNAP02545 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMNAP02545 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMNAP02545 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMNAP02545 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMNAP02545 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMNAP02545 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMNAP02545 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms