Protein–RNA interactions for Protein: P02340

Tp53, Cellular tumor antigen p53, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53P02340 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tp53P02340 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tp53P02340 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tp53P02340 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tp53P02340 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tp53P02340 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tp53P02340 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tp53P02340 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tp53P02340 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tp53P02340 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tp53P02340 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tp53P02340 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tp53P02340 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tp53P02340 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tp53P02340 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tp53P02340 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tp53P02340 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tp53P02340 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tp53P02340 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tp53P02340 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tp53P02340 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tp53P02340 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tp53P02340 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tp53P02340 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tp53P02340 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tp53P02340 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tp53P02340 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tp53P02340 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tp53P02340 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tp53P02340 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tp53P02340 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tp53P02340 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tp53P02340 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tp53P02340 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tp53P02340 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tp53P02340 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tp53P02340 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tp53P02340 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tp53P02340 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tp53P02340 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tp53P02340 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tp53P02340 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tp53P02340 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tp53P02340 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tp53P02340 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tp53P02340 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tp53P02340 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tp53P02340 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tp53P02340 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tp53P02340 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tp53P02340 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tp53P02340 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tp53P02340 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Tp53P02340 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tp53P02340 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tp53P02340 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tp53P02340 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tp53P02340 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tp53P02340 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tp53P02340 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tp53P02340 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tp53P02340 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tp53P02340 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tp53P02340 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tp53P02340 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tp53P02340 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tp53P02340 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tp53P02340 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tp53P02340 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tp53P02340 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tp53P02340 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tp53P02340 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tp53P02340 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tp53P02340 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tp53P02340 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tp53P02340 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tp53P02340 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tp53P02340 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tp53P02340 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tp53P02340 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tp53P02340 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tp53P02340 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tp53P02340 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tp53P02340 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tp53P02340 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tp53P02340 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tp53P02340 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tp53P02340 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tp53P02340 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tp53P02340 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tp53P02340 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tp53P02340 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tp53P02340 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tp53P02340 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tp53P02340 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tp53P02340 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tp53P02340 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tp53P02340 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tp53P02340 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tp53P02340 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms