Protein–RNA interactions for Protein: P01877

IGHA2, Immunoglobulin heavy constant alpha 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHA2P01877 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGHA2P01877 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGHA2P01877 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGHA2P01877 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGHA2P01877 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IGHA2P01877 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IGHA2P01877 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
IGHA2P01877 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
IGHA2P01877 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
IGHA2P01877 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IGHA2P01877 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IGHA2P01877 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IGHA2P01877 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
IGHA2P01877 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
IGHA2P01877 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
IGHA2P01877 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IGHA2P01877 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IGHA2P01877 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
IGHA2P01877 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
IGHA2P01877 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IGHA2P01877 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
IGHA2P01877 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
IGHA2P01877 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.53■■■□□ 2
IGHA2P01877 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IGHA2P01877 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IGHA2P01877 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IGHA2P01877 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IGHA2P01877 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IGHA2P01877 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IGHA2P01877 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IGHA2P01877 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IGHA2P01877 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGHA2P01877 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
IGHA2P01877 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
IGHA2P01877 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGHA2P01877 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
IGHA2P01877 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGHA2P01877 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGHA2P01877 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGHA2P01877 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGHA2P01877 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
IGHA2P01877 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGHA2P01877 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGHA2P01877 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGHA2P01877 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IGHA2P01877 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
IGHA2P01877 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IGHA2P01877 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IGHA2P01877 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IGHA2P01877 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
IGHA2P01877 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IGHA2P01877 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IGHA2P01877 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IGHA2P01877 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IGHA2P01877 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
IGHA2P01877 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IGHA2P01877 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IGHA2P01877 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IGHA2P01877 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IGHA2P01877 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IGHA2P01877 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
IGHA2P01877 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IGHA2P01877 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGHA2P01877 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGHA2P01877 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGHA2P01877 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
IGHA2P01877 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
IGHA2P01877 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGHA2P01877 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGHA2P01877 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGHA2P01877 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGHA2P01877 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGHA2P01877 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGHA2P01877 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IGHA2P01877 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IGHA2P01877 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
IGHA2P01877 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IGHA2P01877 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
IGHA2P01877 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IGHA2P01877 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IGHA2P01877 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGHA2P01877 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGHA2P01877 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGHA2P01877 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGHA2P01877 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGHA2P01877 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
IGHA2P01877 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IGHA2P01877 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IGHA2P01877 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IGHA2P01877 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IGHA2P01877 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IGHA2P01877 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IGHA2P01877 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IGHA2P01877 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IGHA2P01877 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IGHA2P01877 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IGHA2P01877 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IGHA2P01877 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IGHA2P01877 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IGHA2P01877 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms