Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
P01734 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01734 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01734 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01734 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01734 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01734 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01734 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
P01734 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
P01734 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01734 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01734 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01734 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
P01734 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01734 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01734 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01734 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01734 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01734 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01734 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
P01734 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
P01734 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
P01734 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
P01734 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
P01734 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
P01734 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
P01734 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01734 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01734 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01734 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01734 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01734 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01734 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
P01734 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P01734 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P01734 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
P01734 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P01734 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P01734 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
P01734 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01734 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
P01734 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01734 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01734 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01734 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01734 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01734 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01734 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01734 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01734 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01734 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
P01734 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
P01734 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
P01734 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
P01734 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
P01734 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
P01734 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
P01734 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
P01734 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
P01734 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
P01734 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
P01734 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
P01734 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
P01734 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
P01734 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
P01734 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
P01734 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
P01734 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
P01734 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
P01734 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
P01734 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
P01734 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
P01734 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01734 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
P01734 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01734 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01734 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
P01734 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
P01734 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
P01734 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
P01734 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
P01734 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
P01734 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
P01734 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
P01734 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
P01734 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
P01734 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
P01734 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
P01734 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
P01734 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
P01734 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
P01734 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
P01734 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
P01734 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
P01734 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
P01734 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
P01734 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
P01734 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
P01734 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
P01734 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms