Protein–RNA interactions for Protein: P01731

Cd8a, T-cell surface glycoprotein CD8 alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd8aP01731 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd8aP01731 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd8aP01731 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd8aP01731 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd8aP01731 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd8aP01731 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd8aP01731 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd8aP01731 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd8aP01731 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd8aP01731 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd8aP01731 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd8aP01731 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd8aP01731 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd8aP01731 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd8aP01731 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd8aP01731 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd8aP01731 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd8aP01731 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd8aP01731 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd8aP01731 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd8aP01731 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd8aP01731 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd8aP01731 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd8aP01731 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd8aP01731 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd8aP01731 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd8aP01731 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd8aP01731 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd8aP01731 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd8aP01731 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd8aP01731 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd8aP01731 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd8aP01731 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd8aP01731 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd8aP01731 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd8aP01731 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd8aP01731 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd8aP01731 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd8aP01731 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd8aP01731 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd8aP01731 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd8aP01731 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cd8aP01731 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd8aP01731 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd8aP01731 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd8aP01731 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd8aP01731 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd8aP01731 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd8aP01731 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd8aP01731 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd8aP01731 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd8aP01731 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd8aP01731 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd8aP01731 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd8aP01731 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd8aP01731 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd8aP01731 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd8aP01731 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd8aP01731 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd8aP01731 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms