Protein–RNA interactions for Protein: P01656

Ig kappa chain V-III region MOPC 70, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01656 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01656 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01656 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01656 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01656 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01656 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01656 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01656 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01656 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01656 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01656 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01656 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
P01656 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01656 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01656 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01656 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01656 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01656 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01656 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.32■■□□□ 1
P01656 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01656 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
P01656 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01656 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
P01656 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01656 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
P01656 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01656 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
P01656 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.3■■□□□ 1
P01656 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
P01656 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01656 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01656 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01656 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01656 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
P01656 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01656 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01656 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01656 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01656 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01656 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01656 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01656 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01656 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01656 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
P01656 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01656 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01656 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
P01656 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01656 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01656 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01656 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01656 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01656 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01656 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.27■■□□□ 1
P01656 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
P01656 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
P01656 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01656 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01656 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01656 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01656 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01656 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01656 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01656 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01656 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01656 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
P01656 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
P01656 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
P01656 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
P01656 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01656 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01656 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01656 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01656 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01656 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01656 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01656 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01656 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01656 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01656 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01656 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
P01656 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01656 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01656 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01656 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01656 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01656 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01656 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01656 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01656 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01656 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
P01656 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01656 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01656 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01656 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01656 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01656 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01656 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01656 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01656 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms