Protein–RNA interactions for Protein: P01653

Ig kappa chain V-V region W3082, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01653 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01653 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01653 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01653 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01653 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01653 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01653 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01653 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01653 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01653 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01653 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01653 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01653 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01653 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01653 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01653 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01653 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01653 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01653 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01653 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01653 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
P01653 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
P01653 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
P01653 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
P01653 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
P01653 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01653 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01653 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01653 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01653 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01653 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01653 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01653 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01653 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01653 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01653 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01653 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01653 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
P01653 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01653 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01653 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01653 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01653 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01653 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01653 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01653 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P01653 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P01653 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
P01653 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01653 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01653 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01653 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01653 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01653 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
P01653 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01653 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01653 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01653 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01653 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01653 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01653 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01653 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01653 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01653 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01653 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01653 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P01653 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P01653 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
P01653 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P01653 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P01653 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P01653 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
P01653 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P01653 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P01653 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
P01653 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01653 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01653 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01653 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01653 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01653 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01653 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01653 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01653 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01653 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01653 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01653 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01653 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01653 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01653 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01653 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01653 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01653 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01653 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01653 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01653 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01653 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01653 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01653 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01653 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms