Protein–RNA interactions for Protein: P01650

Ig kappa chain V-V region UPC 61, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01650 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01650 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01650 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01650 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01650 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01650 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01650 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01650 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01650 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01650 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01650 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01650 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01650 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01650 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01650 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01650 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01650 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01650 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01650 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01650 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01650 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
P01650 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
P01650 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
P01650 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
P01650 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
P01650 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01650 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01650 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01650 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01650 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01650 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01650 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01650 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01650 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01650 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01650 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01650 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01650 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
P01650 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01650 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01650 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01650 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01650 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01650 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01650 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01650 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P01650 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P01650 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
P01650 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01650 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01650 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01650 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01650 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01650 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
P01650 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01650 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01650 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01650 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01650 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01650 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01650 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01650 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01650 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01650 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01650 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01650 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P01650 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P01650 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
P01650 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P01650 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P01650 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P01650 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
P01650 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P01650 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P01650 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
P01650 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01650 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01650 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01650 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01650 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01650 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01650 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01650 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01650 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01650 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01650 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01650 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01650 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01650 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01650 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01650 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01650 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01650 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01650 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01650 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01650 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01650 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01650 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01650 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01650 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms