Protein–RNA interactions for Protein: O95988

TCL1B, T-cell leukemia/lymphoma protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCL1BO95988 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TCL1BO95988 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCL1BO95988 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCL1BO95988 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCL1BO95988 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCL1BO95988 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCL1BO95988 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCL1BO95988 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCL1BO95988 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCL1BO95988 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCL1BO95988 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCL1BO95988 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCL1BO95988 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCL1BO95988 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCL1BO95988 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCL1BO95988 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCL1BO95988 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TCL1BO95988 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCL1BO95988 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCL1BO95988 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCL1BO95988 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCL1BO95988 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCL1BO95988 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCL1BO95988 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCL1BO95988 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCL1BO95988 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCL1BO95988 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCL1BO95988 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCL1BO95988 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCL1BO95988 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCL1BO95988 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCL1BO95988 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCL1BO95988 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCL1BO95988 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCL1BO95988 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCL1BO95988 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCL1BO95988 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCL1BO95988 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCL1BO95988 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCL1BO95988 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCL1BO95988 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134 ms