Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRD1O95696 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRD1O95696 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRD1O95696 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRD1O95696 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRD1O95696 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRD1O95696 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRD1O95696 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRD1O95696 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRD1O95696 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRD1O95696 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRD1O95696 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRD1O95696 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRD1O95696 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRD1O95696 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
BRD1O95696 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
BRD1O95696 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRD1O95696 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRD1O95696 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRD1O95696 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRD1O95696 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRD1O95696 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRD1O95696 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRD1O95696 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRD1O95696 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRD1O95696 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRD1O95696 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRD1O95696 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRD1O95696 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRD1O95696 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRD1O95696 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRD1O95696 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRD1O95696 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRD1O95696 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
BRD1O95696 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
BRD1O95696 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
BRD1O95696 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
BRD1O95696 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
BRD1O95696 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
BRD1O95696 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
BRD1O95696 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
BRD1O95696 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
BRD1O95696 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRD1O95696 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
BRD1O95696 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
BRD1O95696 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRD1O95696 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRD1O95696 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRD1O95696 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRD1O95696 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRD1O95696 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
BRD1O95696 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRD1O95696 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRD1O95696 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRD1O95696 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRD1O95696 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRD1O95696 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRD1O95696 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
BRD1O95696 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRD1O95696 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRD1O95696 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRD1O95696 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRD1O95696 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRD1O95696 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRD1O95696 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRD1O95696 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRD1O95696 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRD1O95696 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRD1O95696 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRD1O95696 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
BRD1O95696 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRD1O95696 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRD1O95696 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRD1O95696 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRD1O95696 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRD1O95696 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRD1O95696 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRD1O95696 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRD1O95696 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRD1O95696 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRD1O95696 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRD1O95696 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
BRD1O95696 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRD1O95696 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRD1O95696 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRD1O95696 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRD1O95696 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRD1O95696 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRD1O95696 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRD1O95696 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRD1O95696 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRD1O95696 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRD1O95696 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRD1O95696 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRD1O95696 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRD1O95696 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRD1O95696 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRD1O95696 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRD1O95696 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRD1O95696 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms