Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
POLR1AO95602 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
POLR1AO95602 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
POLR1AO95602 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
POLR1AO95602 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
POLR1AO95602 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
POLR1AO95602 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
POLR1AO95602 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
POLR1AO95602 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
POLR1AO95602 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
POLR1AO95602 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
POLR1AO95602 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
POLR1AO95602 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
POLR1AO95602 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
POLR1AO95602 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
POLR1AO95602 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
POLR1AO95602 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
POLR1AO95602 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
POLR1AO95602 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
POLR1AO95602 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
POLR1AO95602 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
POLR1AO95602 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
POLR1AO95602 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
POLR1AO95602 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
POLR1AO95602 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
POLR1AO95602 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
POLR1AO95602 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
POLR1AO95602 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
POLR1AO95602 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
POLR1AO95602 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
POLR1AO95602 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
POLR1AO95602 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
POLR1AO95602 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC35.66■■■■□ 3.3
POLR1AO95602 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
POLR1AO95602 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
POLR1AO95602 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
POLR1AO95602 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
POLR1AO95602 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
POLR1AO95602 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
POLR1AO95602 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
POLR1AO95602 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
POLR1AO95602 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
POLR1AO95602 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
POLR1AO95602 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
POLR1AO95602 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
POLR1AO95602 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
POLR1AO95602 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
POLR1AO95602 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
POLR1AO95602 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
POLR1AO95602 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
POLR1AO95602 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
POLR1AO95602 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
POLR1AO95602 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
POLR1AO95602 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
POLR1AO95602 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
POLR1AO95602 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
POLR1AO95602 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
POLR1AO95602 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
POLR1AO95602 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
POLR1AO95602 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
POLR1AO95602 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
POLR1AO95602 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
POLR1AO95602 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
POLR1AO95602 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
POLR1AO95602 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
POLR1AO95602 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
POLR1AO95602 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
POLR1AO95602 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
POLR1AO95602 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
POLR1AO95602 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
POLR1AO95602 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
POLR1AO95602 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
POLR1AO95602 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
POLR1AO95602 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
POLR1AO95602 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
POLR1AO95602 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
POLR1AO95602 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
POLR1AO95602 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
POLR1AO95602 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
POLR1AO95602 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
POLR1AO95602 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
POLR1AO95602 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
POLR1AO95602 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
POLR1AO95602 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
POLR1AO95602 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC35.51■■■■□ 3.27
POLR1AO95602 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
POLR1AO95602 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
POLR1AO95602 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
POLR1AO95602 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
POLR1AO95602 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
POLR1AO95602 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
POLR1AO95602 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
POLR1AO95602 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
POLR1AO95602 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
POLR1AO95602 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
POLR1AO95602 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC35.49■■■■□ 3.27
POLR1AO95602 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
POLR1AO95602 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
POLR1AO95602 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
POLR1AO95602 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.1 ms