Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
APOL3O95236 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOL3O95236 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOL3O95236 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOL3O95236 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOL3O95236 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOL3O95236 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
APOL3O95236 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOL3O95236 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOL3O95236 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOL3O95236 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOL3O95236 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOL3O95236 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOL3O95236 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOL3O95236 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOL3O95236 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOL3O95236 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOL3O95236 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOL3O95236 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOL3O95236 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOL3O95236 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOL3O95236 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOL3O95236 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOL3O95236 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOL3O95236 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOL3O95236 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOL3O95236 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOL3O95236 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOL3O95236 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
APOL3O95236 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOL3O95236 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOL3O95236 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOL3O95236 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOL3O95236 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOL3O95236 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOL3O95236 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOL3O95236 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOL3O95236 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOL3O95236 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
APOL3O95236 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOL3O95236 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOL3O95236 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOL3O95236 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOL3O95236 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOL3O95236 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOL3O95236 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOL3O95236 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOL3O95236 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOL3O95236 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOL3O95236 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOL3O95236 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOL3O95236 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOL3O95236 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOL3O95236 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOL3O95236 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOL3O95236 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOL3O95236 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOL3O95236 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOL3O95236 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOL3O95236 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOL3O95236 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOL3O95236 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOL3O95236 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOL3O95236 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOL3O95236 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOL3O95236 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOL3O95236 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOL3O95236 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOL3O95236 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOL3O95236 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOL3O95236 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOL3O95236 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOL3O95236 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOL3O95236 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOL3O95236 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOL3O95236 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOL3O95236 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOL3O95236 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOL3O95236 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOL3O95236 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOL3O95236 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOL3O95236 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOL3O95236 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOL3O95236 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOL3O95236 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOL3O95236 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOL3O95236 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOL3O95236 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOL3O95236 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOL3O95236 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOL3O95236 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOL3O95236 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOL3O95236 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOL3O95236 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOL3O95236 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOL3O95236 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOL3O95236 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOL3O95236 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOL3O95236 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOL3O95236 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms