Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN7O94888 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN7O94888 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN7O94888 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN7O94888 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN7O94888 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN7O94888 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN7O94888 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN7O94888 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN7O94888 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN7O94888 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN7O94888 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN7O94888 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN7O94888 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN7O94888 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN7O94888 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN7O94888 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN7O94888 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN7O94888 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN7O94888 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN7O94888 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN7O94888 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN7O94888 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBXN7O94888 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBXN7O94888 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBXN7O94888 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBXN7O94888 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UBXN7O94888 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBXN7O94888 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBXN7O94888 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN7O94888 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN7O94888 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBXN7O94888 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBXN7O94888 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBXN7O94888 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBXN7O94888 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBXN7O94888 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBXN7O94888 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN7O94888 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN7O94888 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN7O94888 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN7O94888 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN7O94888 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBXN7O94888 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBXN7O94888 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBXN7O94888 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN7O94888 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN7O94888 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN7O94888 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN7O94888 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN7O94888 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN7O94888 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN7O94888 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN7O94888 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN7O94888 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN7O94888 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN7O94888 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN7O94888 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN7O94888 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN7O94888 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN7O94888 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN7O94888 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBXN7O94888 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms