Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ShdO88834 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ShdO88834 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ShdO88834 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ShdO88834 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ShdO88834 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ShdO88834 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ShdO88834 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ShdO88834 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ShdO88834 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ShdO88834 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ShdO88834 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ShdO88834 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ShdO88834 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ShdO88834 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ShdO88834 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ShdO88834 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ShdO88834 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ShdO88834 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ShdO88834 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ShdO88834 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ShdO88834 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ShdO88834 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ShdO88834 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ShdO88834 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ShdO88834 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ShdO88834 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ShdO88834 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ShdO88834 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ShdO88834 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ShdO88834 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ShdO88834 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ShdO88834 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ShdO88834 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ShdO88834 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ShdO88834 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ShdO88834 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ShdO88834 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ShdO88834 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ShdO88834 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ShdO88834 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ShdO88834 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ShdO88834 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ShdO88834 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ShdO88834 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ShdO88834 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ShdO88834 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ShdO88834 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ShdO88834 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ShdO88834 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ShdO88834 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ShdO88834 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ShdO88834 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ShdO88834 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ShdO88834 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ShdO88834 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ShdO88834 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ShdO88834 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ShdO88834 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ShdO88834 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ShdO88834 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ShdO88834 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ShdO88834 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ShdO88834 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ShdO88834 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ShdO88834 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ShdO88834 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ShdO88834 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ShdO88834 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ShdO88834 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ShdO88834 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ShdO88834 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ShdO88834 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ShdO88834 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ShdO88834 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ShdO88834 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ShdO88834 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ShdO88834 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ShdO88834 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ShdO88834 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ShdO88834 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ShdO88834 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ShdO88834 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ShdO88834 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ShdO88834 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ShdO88834 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ShdO88834 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ShdO88834 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ShdO88834 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ShdO88834 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ShdO88834 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ShdO88834 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ShdO88834 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ShdO88834 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ShdO88834 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ShdO88834 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ShdO88834 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ShdO88834 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ShdO88834 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ShdO88834 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms