Protein–RNA interactions for Protein: O88554

Parp2, Poly [ADP-ribose] polymerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp2O88554 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Parp2O88554 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Parp2O88554 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Parp2O88554 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Parp2O88554 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Parp2O88554 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Parp2O88554 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Parp2O88554 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Parp2O88554 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Parp2O88554 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Parp2O88554 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Parp2O88554 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Parp2O88554 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Parp2O88554 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Parp2O88554 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Parp2O88554 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Parp2O88554 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Parp2O88554 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Parp2O88554 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Parp2O88554 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Parp2O88554 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Parp2O88554 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Parp2O88554 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Parp2O88554 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Parp2O88554 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Parp2O88554 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Parp2O88554 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Parp2O88554 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Parp2O88554 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Parp2O88554 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Parp2O88554 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Parp2O88554 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Parp2O88554 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Parp2O88554 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Parp2O88554 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Parp2O88554 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Parp2O88554 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Parp2O88554 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Parp2O88554 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Parp2O88554 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Parp2O88554 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Parp2O88554 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Parp2O88554 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Parp2O88554 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Parp2O88554 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Parp2O88554 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Parp2O88554 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Parp2O88554 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Parp2O88554 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Parp2O88554 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Parp2O88554 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Parp2O88554 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Parp2O88554 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Parp2O88554 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Parp2O88554 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Parp2O88554 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Parp2O88554 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Parp2O88554 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Parp2O88554 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Parp2O88554 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Parp2O88554 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Parp2O88554 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Parp2O88554 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Parp2O88554 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Parp2O88554 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Parp2O88554 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Parp2O88554 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Parp2O88554 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Parp2O88554 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Parp2O88554 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Parp2O88554 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Parp2O88554 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Parp2O88554 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Parp2O88554 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Parp2O88554 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Parp2O88554 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Parp2O88554 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Parp2O88554 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Parp2O88554 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Parp2O88554 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Parp2O88554 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Parp2O88554 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Parp2O88554 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Parp2O88554 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Parp2O88554 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Parp2O88554 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Parp2O88554 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Parp2O88554 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Parp2O88554 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Parp2O88554 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Parp2O88554 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Parp2O88554 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Parp2O88554 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Parp2O88554 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Parp2O88554 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Parp2O88554 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Parp2O88554 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Parp2O88554 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Parp2O88554 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Parp2O88554 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms