Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnmt3bO88509 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnmt3bO88509 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnmt3bO88509 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnmt3bO88509 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnmt3bO88509 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnmt3bO88509 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnmt3bO88509 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dnmt3bO88509 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnmt3bO88509 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnmt3bO88509 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnmt3bO88509 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnmt3bO88509 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnmt3bO88509 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnmt3bO88509 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnmt3bO88509 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnmt3bO88509 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnmt3bO88509 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnmt3bO88509 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnmt3bO88509 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnmt3bO88509 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnmt3bO88509 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnmt3bO88509 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnmt3bO88509 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnmt3bO88509 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnmt3bO88509 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnmt3bO88509 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnmt3bO88509 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnmt3bO88509 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnmt3bO88509 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnmt3bO88509 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnmt3bO88509 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnmt3bO88509 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnmt3bO88509 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnmt3bO88509 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dnmt3bO88509 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dnmt3bO88509 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dnmt3bO88509 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Dnmt3bO88509 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnmt3bO88509 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms