Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capns1O88456 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capns1O88456 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capns1O88456 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capns1O88456 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capns1O88456 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capns1O88456 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capns1O88456 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capns1O88456 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capns1O88456 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capns1O88456 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capns1O88456 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capns1O88456 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capns1O88456 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capns1O88456 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capns1O88456 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Capns1O88456 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capns1O88456 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capns1O88456 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capns1O88456 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Capns1O88456 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Capns1O88456 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Capns1O88456 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Capns1O88456 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Capns1O88456 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Capns1O88456 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Capns1O88456 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Capns1O88456 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Capns1O88456 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capns1O88456 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capns1O88456 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capns1O88456 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capns1O88456 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Capns1O88456 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capns1O88456 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capns1O88456 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capns1O88456 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Capns1O88456 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Capns1O88456 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capns1O88456 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capns1O88456 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capns1O88456 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capns1O88456 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capns1O88456 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capns1O88456 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capns1O88456 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Capns1O88456 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capns1O88456 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Capns1O88456 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Capns1O88456 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Capns1O88456 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Capns1O88456 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Capns1O88456 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Capns1O88456 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Capns1O88456 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Capns1O88456 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Capns1O88456 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Capns1O88456 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capns1O88456 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Capns1O88456 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capns1O88456 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capns1O88456 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capns1O88456 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capns1O88456 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Capns1O88456 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Capns1O88456 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Capns1O88456 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Capns1O88456 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Capns1O88456 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Capns1O88456 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capns1O88456 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capns1O88456 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capns1O88456 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capns1O88456 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capns1O88456 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Capns1O88456 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Capns1O88456 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Capns1O88456 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Capns1O88456 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capns1O88456 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capns1O88456 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capns1O88456 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capns1O88456 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capns1O88456 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capns1O88456 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capns1O88456 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capns1O88456 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capns1O88456 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capns1O88456 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capns1O88456 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capns1O88456 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capns1O88456 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capns1O88456 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capns1O88456 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capns1O88456 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Capns1O88456 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Capns1O88456 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Capns1O88456 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Capns1O88456 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Capns1O88456 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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