Protein–RNA interactions for Protein: O88188

Ly86, Lymphocyte antigen 86, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly86O88188 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly86O88188 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly86O88188 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly86O88188 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly86O88188 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly86O88188 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly86O88188 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly86O88188 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly86O88188 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly86O88188 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ly86O88188 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ly86O88188 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ly86O88188 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ly86O88188 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ly86O88188 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ly86O88188 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ly86O88188 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ly86O88188 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ly86O88188 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ly86O88188 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ly86O88188 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ly86O88188 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ly86O88188 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ly86O88188 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly86O88188 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly86O88188 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly86O88188 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly86O88188 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly86O88188 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly86O88188 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ly86O88188 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ly86O88188 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ly86O88188 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ly86O88188 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ly86O88188 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ly86O88188 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ly86O88188 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ly86O88188 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ly86O88188 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ly86O88188 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ly86O88188 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ly86O88188 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ly86O88188 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ly86O88188 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ly86O88188 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms