Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEBLO76041 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEBLO76041 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEBLO76041 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEBLO76041 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEBLO76041 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEBLO76041 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEBLO76041 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEBLO76041 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEBLO76041 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEBLO76041 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEBLO76041 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEBLO76041 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEBLO76041 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEBLO76041 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEBLO76041 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEBLO76041 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEBLO76041 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEBLO76041 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEBLO76041 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEBLO76041 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEBLO76041 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEBLO76041 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEBLO76041 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEBLO76041 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEBLO76041 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEBLO76041 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEBLO76041 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEBLO76041 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEBLO76041 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NEBLO76041 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEBLO76041 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEBLO76041 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEBLO76041 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEBLO76041 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEBLO76041 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEBLO76041 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEBLO76041 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NEBLO76041 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NEBLO76041 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NEBLO76041 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEBLO76041 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEBLO76041 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEBLO76041 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEBLO76041 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEBLO76041 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEBLO76041 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEBLO76041 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEBLO76041 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEBLO76041 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEBLO76041 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEBLO76041 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEBLO76041 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEBLO76041 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEBLO76041 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEBLO76041 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEBLO76041 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEBLO76041 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEBLO76041 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEBLO76041 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEBLO76041 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEBLO76041 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEBLO76041 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEBLO76041 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEBLO76041 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEBLO76041 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEBLO76041 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEBLO76041 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEBLO76041 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEBLO76041 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEBLO76041 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEBLO76041 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEBLO76041 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEBLO76041 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEBLO76041 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEBLO76041 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEBLO76041 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEBLO76041 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEBLO76041 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEBLO76041 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEBLO76041 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEBLO76041 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEBLO76041 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEBLO76041 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEBLO76041 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEBLO76041 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEBLO76041 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEBLO76041 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEBLO76041 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEBLO76041 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEBLO76041 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEBLO76041 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEBLO76041 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEBLO76041 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEBLO76041 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEBLO76041 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEBLO76041 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEBLO76041 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEBLO76041 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEBLO76041 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.3 ms