Protein–RNA interactions for Protein: O75530

EED, Polycomb protein EED, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEDO75530 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EEDO75530 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EEDO75530 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EEDO75530 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EEDO75530 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EEDO75530 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EEDO75530 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EEDO75530 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EEDO75530 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EEDO75530 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EEDO75530 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EEDO75530 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EEDO75530 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EEDO75530 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EEDO75530 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EEDO75530 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EEDO75530 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EEDO75530 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EEDO75530 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EEDO75530 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EEDO75530 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EEDO75530 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EEDO75530 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EEDO75530 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EEDO75530 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EEDO75530 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EEDO75530 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EEDO75530 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EEDO75530 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EEDO75530 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EEDO75530 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EEDO75530 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EEDO75530 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EEDO75530 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EEDO75530 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EEDO75530 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EEDO75530 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EEDO75530 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EEDO75530 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EEDO75530 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EEDO75530 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EEDO75530 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EEDO75530 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EEDO75530 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EEDO75530 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EEDO75530 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EEDO75530 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EEDO75530 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EEDO75530 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EEDO75530 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EEDO75530 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EEDO75530 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EEDO75530 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EEDO75530 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EEDO75530 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EEDO75530 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EEDO75530 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EEDO75530 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EEDO75530 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EEDO75530 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEDO75530 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEDO75530 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEDO75530 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEDO75530 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEDO75530 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EEDO75530 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEDO75530 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEDO75530 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEDO75530 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEDO75530 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEDO75530 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEDO75530 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEDO75530 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEDO75530 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEDO75530 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEDO75530 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEDO75530 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEDO75530 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEDO75530 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEDO75530 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEDO75530 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEDO75530 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEDO75530 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEDO75530 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEDO75530 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEDO75530 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EEDO75530 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EEDO75530 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EEDO75530 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EEDO75530 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EEDO75530 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EEDO75530 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EEDO75530 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EEDO75530 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EEDO75530 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EEDO75530 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EEDO75530 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EEDO75530 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EEDO75530 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EEDO75530 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms