Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stra6O70491 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stra6O70491 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stra6O70491 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stra6O70491 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stra6O70491 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stra6O70491 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stra6O70491 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stra6O70491 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stra6O70491 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stra6O70491 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stra6O70491 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stra6O70491 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stra6O70491 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stra6O70491 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stra6O70491 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Stra6O70491 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Stra6O70491 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stra6O70491 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stra6O70491 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Stra6O70491 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stra6O70491 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Stra6O70491 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stra6O70491 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stra6O70491 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stra6O70491 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stra6O70491 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stra6O70491 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stra6O70491 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stra6O70491 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stra6O70491 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stra6O70491 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stra6O70491 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stra6O70491 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stra6O70491 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stra6O70491 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stra6O70491 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stra6O70491 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stra6O70491 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stra6O70491 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stra6O70491 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stra6O70491 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stra6O70491 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Stra6O70491 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stra6O70491 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stra6O70491 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stra6O70491 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stra6O70491 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stra6O70491 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stra6O70491 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stra6O70491 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stra6O70491 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stra6O70491 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stra6O70491 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stra6O70491 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stra6O70491 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stra6O70491 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stra6O70491 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stra6O70491 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stra6O70491 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stra6O70491 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stra6O70491 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stra6O70491 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stra6O70491 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stra6O70491 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Stra6O70491 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stra6O70491 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stra6O70491 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stra6O70491 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stra6O70491 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stra6O70491 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stra6O70491 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stra6O70491 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stra6O70491 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stra6O70491 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stra6O70491 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stra6O70491 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stra6O70491 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stra6O70491 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stra6O70491 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stra6O70491 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stra6O70491 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stra6O70491 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stra6O70491 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stra6O70491 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stra6O70491 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stra6O70491 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stra6O70491 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stra6O70491 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stra6O70491 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stra6O70491 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stra6O70491 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Stra6O70491 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stra6O70491 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stra6O70491 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stra6O70491 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stra6O70491 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Stra6O70491 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stra6O70491 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stra6O70491 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms