Protein–RNA interactions for Protein: O60749

SNX2, Sorting nexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX2O60749 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX2O60749 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX2O60749 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX2O60749 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX2O60749 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX2O60749 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX2O60749 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX2O60749 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX2O60749 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX2O60749 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX2O60749 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX2O60749 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX2O60749 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX2O60749 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX2O60749 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX2O60749 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX2O60749 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX2O60749 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX2O60749 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX2O60749 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX2O60749 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX2O60749 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX2O60749 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX2O60749 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX2O60749 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX2O60749 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX2O60749 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX2O60749 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX2O60749 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX2O60749 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX2O60749 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX2O60749 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX2O60749 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX2O60749 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX2O60749 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX2O60749 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX2O60749 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX2O60749 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX2O60749 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX2O60749 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX2O60749 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX2O60749 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX2O60749 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX2O60749 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX2O60749 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX2O60749 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX2O60749 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX2O60749 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX2O60749 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX2O60749 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX2O60749 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX2O60749 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX2O60749 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX2O60749 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX2O60749 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX2O60749 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX2O60749 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX2O60749 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX2O60749 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX2O60749 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX2O60749 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX2O60749 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX2O60749 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX2O60749 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX2O60749 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX2O60749 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX2O60749 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX2O60749 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX2O60749 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX2O60749 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX2O60749 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX2O60749 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX2O60749 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX2O60749 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX2O60749 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX2O60749 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX2O60749 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX2O60749 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX2O60749 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX2O60749 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX2O60749 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX2O60749 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX2O60749 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX2O60749 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX2O60749 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX2O60749 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX2O60749 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX2O60749 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX2O60749 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX2O60749 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX2O60749 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX2O60749 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX2O60749 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX2O60749 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX2O60749 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX2O60749 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX2O60749 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX2O60749 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX2O60749 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX2O60749 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms