Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SELENOFO60613 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SELENOFO60613 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SELENOFO60613 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SELENOFO60613 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SELENOFO60613 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SELENOFO60613 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SELENOFO60613 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SELENOFO60613 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SELENOFO60613 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SELENOFO60613 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SELENOFO60613 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SELENOFO60613 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SELENOFO60613 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SELENOFO60613 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SELENOFO60613 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SELENOFO60613 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SELENOFO60613 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SELENOFO60613 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SELENOFO60613 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SELENOFO60613 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SELENOFO60613 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SELENOFO60613 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SELENOFO60613 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SELENOFO60613 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SELENOFO60613 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SELENOFO60613 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SELENOFO60613 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SELENOFO60613 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SELENOFO60613 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms