Protein–RNA interactions for Protein: O60563

CCNT1, Cyclin-T1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNT1O60563 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCNT1O60563 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCNT1O60563 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCNT1O60563 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CCNT1O60563 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCNT1O60563 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCNT1O60563 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCNT1O60563 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCNT1O60563 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CCNT1O60563 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCNT1O60563 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCNT1O60563 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCNT1O60563 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCNT1O60563 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCNT1O60563 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCNT1O60563 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCNT1O60563 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCNT1O60563 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCNT1O60563 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCNT1O60563 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCNT1O60563 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCNT1O60563 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCNT1O60563 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CCNT1O60563 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCNT1O60563 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCNT1O60563 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCNT1O60563 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CCNT1O60563 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNT1O60563 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNT1O60563 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNT1O60563 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNT1O60563 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNT1O60563 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNT1O60563 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNT1O60563 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNT1O60563 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCNT1O60563 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCNT1O60563 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCNT1O60563 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCNT1O60563 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCNT1O60563 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCNT1O60563 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCNT1O60563 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCNT1O60563 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCNT1O60563 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCNT1O60563 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCNT1O60563 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCNT1O60563 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCNT1O60563 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCNT1O60563 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCNT1O60563 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCNT1O60563 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCNT1O60563 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCNT1O60563 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCNT1O60563 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCNT1O60563 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCNT1O60563 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCNT1O60563 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCNT1O60563 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCNT1O60563 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCNT1O60563 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCNT1O60563 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
CCNT1O60563 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCNT1O60563 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCNT1O60563 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCNT1O60563 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCNT1O60563 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCNT1O60563 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCNT1O60563 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCNT1O60563 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCNT1O60563 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCNT1O60563 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCNT1O60563 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCNT1O60563 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCNT1O60563 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCNT1O60563 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCNT1O60563 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCNT1O60563 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CCNT1O60563 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CCNT1O60563 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNT1O60563 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNT1O60563 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNT1O60563 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNT1O60563 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNT1O60563 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNT1O60563 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNT1O60563 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNT1O60563 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNT1O60563 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNT1O60563 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNT1O60563 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCNT1O60563 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCNT1O60563 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCNT1O60563 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CCNT1O60563 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CCNT1O60563 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCNT1O60563 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCNT1O60563 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCNT1O60563 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCNT1O60563 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms