Protein–RNA interactions for Protein: O60481

ZIC3, Zinc finger protein ZIC 3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC3O60481 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZIC3O60481 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZIC3O60481 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZIC3O60481 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZIC3O60481 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZIC3O60481 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZIC3O60481 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZIC3O60481 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZIC3O60481 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZIC3O60481 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZIC3O60481 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZIC3O60481 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZIC3O60481 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZIC3O60481 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZIC3O60481 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZIC3O60481 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZIC3O60481 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZIC3O60481 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZIC3O60481 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZIC3O60481 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZIC3O60481 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZIC3O60481 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZIC3O60481 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZIC3O60481 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZIC3O60481 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZIC3O60481 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZIC3O60481 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZIC3O60481 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZIC3O60481 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZIC3O60481 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZIC3O60481 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZIC3O60481 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZIC3O60481 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZIC3O60481 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZIC3O60481 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZIC3O60481 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZIC3O60481 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZIC3O60481 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZIC3O60481 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZIC3O60481 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZIC3O60481 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZIC3O60481 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZIC3O60481 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZIC3O60481 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZIC3O60481 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZIC3O60481 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZIC3O60481 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZIC3O60481 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms