Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAK2O60296 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAK2O60296 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAK2O60296 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAK2O60296 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAK2O60296 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAK2O60296 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAK2O60296 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAK2O60296 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAK2O60296 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAK2O60296 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAK2O60296 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAK2O60296 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAK2O60296 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAK2O60296 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAK2O60296 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAK2O60296 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAK2O60296 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAK2O60296 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAK2O60296 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAK2O60296 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAK2O60296 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAK2O60296 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAK2O60296 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAK2O60296 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAK2O60296 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAK2O60296 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAK2O60296 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAK2O60296 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAK2O60296 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAK2O60296 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAK2O60296 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAK2O60296 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAK2O60296 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAK2O60296 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAK2O60296 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAK2O60296 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAK2O60296 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAK2O60296 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAK2O60296 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAK2O60296 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAK2O60296 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAK2O60296 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAK2O60296 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAK2O60296 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAK2O60296 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAK2O60296 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAK2O60296 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAK2O60296 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TRAK2O60296 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TRAK2O60296 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TRAK2O60296 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAK2O60296 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAK2O60296 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAK2O60296 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAK2O60296 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAK2O60296 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAK2O60296 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAK2O60296 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAK2O60296 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAK2O60296 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAK2O60296 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAK2O60296 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAK2O60296 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAK2O60296 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAK2O60296 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAK2O60296 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAK2O60296 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAK2O60296 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAK2O60296 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAK2O60296 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAK2O60296 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAK2O60296 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAK2O60296 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRAK2O60296 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRAK2O60296 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1944.1 ms