Protein–RNA interactions for Protein: O60260

PRKN, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKNO60260 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKNO60260 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKNO60260 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKNO60260 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKNO60260 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKNO60260 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKNO60260 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKNO60260 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKNO60260 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKNO60260 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKNO60260 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKNO60260 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKNO60260 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKNO60260 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKNO60260 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKNO60260 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKNO60260 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKNO60260 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKNO60260 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKNO60260 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKNO60260 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKNO60260 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKNO60260 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKNO60260 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKNO60260 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKNO60260 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKNO60260 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKNO60260 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKNO60260 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKNO60260 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKNO60260 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKNO60260 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKNO60260 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKNO60260 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKNO60260 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKNO60260 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKNO60260 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKNO60260 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKNO60260 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKNO60260 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKNO60260 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKNO60260 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKNO60260 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKNO60260 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKNO60260 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKNO60260 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKNO60260 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKNO60260 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKNO60260 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKNO60260 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKNO60260 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKNO60260 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKNO60260 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKNO60260 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKNO60260 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKNO60260 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKNO60260 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKNO60260 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKNO60260 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKNO60260 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKNO60260 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKNO60260 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKNO60260 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKNO60260 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKNO60260 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKNO60260 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKNO60260 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKNO60260 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKNO60260 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKNO60260 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKNO60260 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKNO60260 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKNO60260 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKNO60260 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKNO60260 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKNO60260 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKNO60260 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKNO60260 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKNO60260 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKNO60260 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKNO60260 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKNO60260 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKNO60260 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKNO60260 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKNO60260 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKNO60260 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKNO60260 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKNO60260 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKNO60260 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKNO60260 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKNO60260 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKNO60260 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKNO60260 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKNO60260 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKNO60260 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKNO60260 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKNO60260 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKNO60260 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKNO60260 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKNO60260 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.9 ms