Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlx3O55144 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlx3O55144 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlx3O55144 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlx3O55144 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlx3O55144 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlx3O55144 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlx3O55144 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlx3O55144 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlx3O55144 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlx3O55144 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlx3O55144 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlx3O55144 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlx3O55144 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlx3O55144 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlx3O55144 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlx3O55144 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlx3O55144 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlx3O55144 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlx3O55144 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlx3O55144 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlx3O55144 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlx3O55144 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlx3O55144 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlx3O55144 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlx3O55144 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlx3O55144 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlx3O55144 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tlx3O55144 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tlx3O55144 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlx3O55144 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlx3O55144 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlx3O55144 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlx3O55144 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlx3O55144 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlx3O55144 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlx3O55144 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlx3O55144 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlx3O55144 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlx3O55144 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlx3O55144 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlx3O55144 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlx3O55144 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlx3O55144 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlx3O55144 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlx3O55144 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlx3O55144 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlx3O55144 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlx3O55144 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlx3O55144 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlx3O55144 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlx3O55144 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlx3O55144 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlx3O55144 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlx3O55144 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlx3O55144 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlx3O55144 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlx3O55144 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlx3O55144 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlx3O55144 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlx3O55144 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlx3O55144 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlx3O55144 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlx3O55144 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlx3O55144 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlx3O55144 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tlx3O55144 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlx3O55144 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlx3O55144 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlx3O55144 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlx3O55144 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlx3O55144 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlx3O55144 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlx3O55144 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlx3O55144 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlx3O55144 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlx3O55144 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlx3O55144 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlx3O55144 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlx3O55144 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlx3O55144 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlx3O55144 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlx3O55144 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlx3O55144 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlx3O55144 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlx3O55144 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlx3O55144 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlx3O55144 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tlx3O55144 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tlx3O55144 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tlx3O55144 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlx3O55144 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlx3O55144 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlx3O55144 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlx3O55144 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlx3O55144 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlx3O55144 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlx3O55144 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlx3O55144 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlx3O55144 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms