Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dsg2O55111 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dsg2O55111 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dsg2O55111 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dsg2O55111 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dsg2O55111 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dsg2O55111 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dsg2O55111 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dsg2O55111 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dsg2O55111 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dsg2O55111 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dsg2O55111 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dsg2O55111 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dsg2O55111 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dsg2O55111 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Dsg2O55111 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dsg2O55111 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dsg2O55111 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dsg2O55111 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dsg2O55111 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dsg2O55111 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dsg2O55111 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dsg2O55111 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dsg2O55111 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dsg2O55111 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dsg2O55111 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dsg2O55111 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dsg2O55111 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dsg2O55111 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Dsg2O55111 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dsg2O55111 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dsg2O55111 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dsg2O55111 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dsg2O55111 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dsg2O55111 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dsg2O55111 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dsg2O55111 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dsg2O55111 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dsg2O55111 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dsg2O55111 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dsg2O55111 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dsg2O55111 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Dsg2O55111 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dsg2O55111 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dsg2O55111 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Dsg2O55111 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dsg2O55111 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dsg2O55111 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dsg2O55111 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dsg2O55111 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dsg2O55111 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dsg2O55111 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dsg2O55111 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dsg2O55111 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dsg2O55111 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dsg2O55111 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dsg2O55111 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dsg2O55111 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dsg2O55111 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dsg2O55111 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dsg2O55111 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dsg2O55111 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Dsg2O55111 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dsg2O55111 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dsg2O55111 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dsg2O55111 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Dsg2O55111 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dsg2O55111 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dsg2O55111 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dsg2O55111 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dsg2O55111 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dsg2O55111 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dsg2O55111 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dsg2O55111 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dsg2O55111 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dsg2O55111 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Dsg2O55111 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dsg2O55111 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dsg2O55111 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dsg2O55111 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dsg2O55111 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Dsg2O55111 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dsg2O55111 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dsg2O55111 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dsg2O55111 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms