Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1bO55017 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1bO55017 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1bO55017 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1bO55017 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1bO55017 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1bO55017 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1bO55017 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1bO55017 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna1bO55017 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna1bO55017 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1bO55017 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1bO55017 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1bO55017 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1bO55017 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna1bO55017 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna1bO55017 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna1bO55017 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cacna1bO55017 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna1bO55017 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna1bO55017 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna1bO55017 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna1bO55017 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna1bO55017 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1bO55017 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1bO55017 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1bO55017 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1bO55017 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1bO55017 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1bO55017 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1bO55017 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1bO55017 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1bO55017 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1bO55017 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1bO55017 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1bO55017 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1bO55017 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1bO55017 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1bO55017 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1bO55017 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1bO55017 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1bO55017 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna1bO55017 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Cacna1bO55017 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1bO55017 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1bO55017 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1bO55017 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1bO55017 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1bO55017 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1bO55017 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1bO55017 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1bO55017 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1bO55017 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1bO55017 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1bO55017 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna1bO55017 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna1bO55017 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna1bO55017 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna1bO55017 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna1bO55017 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1bO55017 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1bO55017 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1bO55017 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1bO55017 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1bO55017 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1bO55017 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1bO55017 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1bO55017 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1bO55017 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1bO55017 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1bO55017 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna1bO55017 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna1bO55017 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna1bO55017 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna1bO55017 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cacna1bO55017 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cacna1bO55017 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cacna1bO55017 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cacna1bO55017 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cacna1bO55017 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cacna1bO55017 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cacna1bO55017 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cacna1bO55017 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cacna1bO55017 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacna1bO55017 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacna1bO55017 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna1bO55017 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna1bO55017 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna1bO55017 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna1bO55017 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna1bO55017 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna1bO55017 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna1bO55017 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna1bO55017 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna1bO55017 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna1bO55017 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacna1bO55017 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacna1bO55017 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacna1bO55017 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacna1bO55017 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.5 ms