Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SlkO54988 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SlkO54988 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SlkO54988 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SlkO54988 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SlkO54988 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SlkO54988 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SlkO54988 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SlkO54988 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SlkO54988 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SlkO54988 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SlkO54988 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SlkO54988 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SlkO54988 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SlkO54988 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SlkO54988 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SlkO54988 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SlkO54988 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SlkO54988 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SlkO54988 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SlkO54988 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SlkO54988 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SlkO54988 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SlkO54988 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SlkO54988 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SlkO54988 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SlkO54988 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SlkO54988 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SlkO54988 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SlkO54988 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SlkO54988 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SlkO54988 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SlkO54988 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SlkO54988 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SlkO54988 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SlkO54988 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SlkO54988 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SlkO54988 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SlkO54988 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SlkO54988 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SlkO54988 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SlkO54988 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SlkO54988 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SlkO54988 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SlkO54988 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SlkO54988 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SlkO54988 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SlkO54988 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SlkO54988 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SlkO54988 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SlkO54988 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SlkO54988 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SlkO54988 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SlkO54988 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SlkO54988 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SlkO54988 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SlkO54988 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SlkO54988 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SlkO54988 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SlkO54988 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SlkO54988 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SlkO54988 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SlkO54988 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SlkO54988 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SlkO54988 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SlkO54988 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SlkO54988 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SlkO54988 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SlkO54988 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SlkO54988 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SlkO54988 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SlkO54988 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SlkO54988 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SlkO54988 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SlkO54988 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SlkO54988 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SlkO54988 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SlkO54988 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SlkO54988 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SlkO54988 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SlkO54988 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SlkO54988 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SlkO54988 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SlkO54988 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SlkO54988 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SlkO54988 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SlkO54988 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SlkO54988 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SlkO54988 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SlkO54988 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SlkO54988 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SlkO54988 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SlkO54988 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SlkO54988 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SlkO54988 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SlkO54988 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SlkO54988 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SlkO54988 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SlkO54988 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SlkO54988 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms