Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ChkaO54804 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChkaO54804 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChkaO54804 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChkaO54804 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChkaO54804 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChkaO54804 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChkaO54804 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChkaO54804 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChkaO54804 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChkaO54804 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChkaO54804 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ChkaO54804 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ChkaO54804 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChkaO54804 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChkaO54804 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChkaO54804 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChkaO54804 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChkaO54804 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChkaO54804 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChkaO54804 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChkaO54804 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChkaO54804 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChkaO54804 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChkaO54804 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChkaO54804 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChkaO54804 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ChkaO54804 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChkaO54804 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChkaO54804 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChkaO54804 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChkaO54804 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ChkaO54804 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChkaO54804 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChkaO54804 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChkaO54804 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ChkaO54804 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChkaO54804 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChkaO54804 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChkaO54804 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChkaO54804 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ChkaO54804 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChkaO54804 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChkaO54804 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChkaO54804 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChkaO54804 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChkaO54804 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChkaO54804 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChkaO54804 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChkaO54804 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChkaO54804 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChkaO54804 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChkaO54804 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChkaO54804 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ChkaO54804 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChkaO54804 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChkaO54804 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChkaO54804 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ChkaO54804 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChkaO54804 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms