Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrxO54751 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CrxO54751 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrxO54751 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrxO54751 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrxO54751 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrxO54751 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrxO54751 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrxO54751 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrxO54751 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrxO54751 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrxO54751 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrxO54751 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrxO54751 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrxO54751 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrxO54751 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrxO54751 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrxO54751 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrxO54751 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrxO54751 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrxO54751 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrxO54751 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrxO54751 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrxO54751 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrxO54751 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrxO54751 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrxO54751 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrxO54751 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrxO54751 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrxO54751 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrxO54751 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrxO54751 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrxO54751 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrxO54751 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrxO54751 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrxO54751 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrxO54751 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrxO54751 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrxO54751 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CrxO54751 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CrxO54751 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CrxO54751 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CrxO54751 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CrxO54751 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CrxO54751 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CrxO54751 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CrxO54751 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CrxO54751 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrxO54751 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CrxO54751 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrxO54751 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrxO54751 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrxO54751 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrxO54751 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrxO54751 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrxO54751 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrxO54751 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrxO54751 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrxO54751 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrxO54751 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CrxO54751 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CrxO54751 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CrxO54751 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CrxO54751 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CrxO54751 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CrxO54751 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CrxO54751 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CrxO54751 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CrxO54751 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CrxO54751 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CrxO54751 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CrxO54751 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CrxO54751 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CrxO54751 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CrxO54751 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CrxO54751 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CrxO54751 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CrxO54751 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CrxO54751 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CrxO54751 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CrxO54751 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CrxO54751 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CrxO54751 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CrxO54751 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CrxO54751 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CrxO54751 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CrxO54751 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CrxO54751 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CrxO54751 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CrxO54751 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CrxO54751 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CrxO54751 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CrxO54751 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CrxO54751 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CrxO54751 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CrxO54751 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CrxO54751 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CrxO54751 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CrxO54751 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CrxO54751 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.3 ms