Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CREB3O43889 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CREB3O43889 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CREB3O43889 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CREB3O43889 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CREB3O43889 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CREB3O43889 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CREB3O43889 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CREB3O43889 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CREB3O43889 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CREB3O43889 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CREB3O43889 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CREB3O43889 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CREB3O43889 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CREB3O43889 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CREB3O43889 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CREB3O43889 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CREB3O43889 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CREB3O43889 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CREB3O43889 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CREB3O43889 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CREB3O43889 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CREB3O43889 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CREB3O43889 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CREB3O43889 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CREB3O43889 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CREB3O43889 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CREB3O43889 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CREB3O43889 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CREB3O43889 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CREB3O43889 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CREB3O43889 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CREB3O43889 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CREB3O43889 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CREB3O43889 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CREB3O43889 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CREB3O43889 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CREB3O43889 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CREB3O43889 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CREB3O43889 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CREB3O43889 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CREB3O43889 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CREB3O43889 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CREB3O43889 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CREB3O43889 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CREB3O43889 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CREB3O43889 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CREB3O43889 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CREB3O43889 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CREB3O43889 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CREB3O43889 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CREB3O43889 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CREB3O43889 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CREB3O43889 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CREB3O43889 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CREB3O43889 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CREB3O43889 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CREB3O43889 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CREB3O43889 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CREB3O43889 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CREB3O43889 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CREB3O43889 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CREB3O43889 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CREB3O43889 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CREB3O43889 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CREB3O43889 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CREB3O43889 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CREB3O43889 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CREB3O43889 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CREB3O43889 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CREB3O43889 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CREB3O43889 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CREB3O43889 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CREB3O43889 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CREB3O43889 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CREB3O43889 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CREB3O43889 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CREB3O43889 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CREB3O43889 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CREB3O43889 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CREB3O43889 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CREB3O43889 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CREB3O43889 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CREB3O43889 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CREB3O43889 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CREB3O43889 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CREB3O43889 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CREB3O43889 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CREB3O43889 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CREB3O43889 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CREB3O43889 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CREB3O43889 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CREB3O43889 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CREB3O43889 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CREB3O43889 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CREB3O43889 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CREB3O43889 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CREB3O43889 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CREB3O43889 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CREB3O43889 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms