Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP3K13O43283 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP3K13O43283 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP3K13O43283 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP3K13O43283 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP3K13O43283 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP3K13O43283 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP3K13O43283 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP3K13O43283 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP3K13O43283 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP3K13O43283 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP3K13O43283 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP3K13O43283 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP3K13O43283 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP3K13O43283 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP3K13O43283 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP3K13O43283 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP3K13O43283 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP3K13O43283 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP3K13O43283 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP3K13O43283 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP3K13O43283 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP3K13O43283 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAP3K13O43283 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAP3K13O43283 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAP3K13O43283 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAP3K13O43283 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAP3K13O43283 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAP3K13O43283 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MAP3K13O43283 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MAP3K13O43283 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MAP3K13O43283 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
MAP3K13O43283 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAP3K13O43283 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MAP3K13O43283 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAP3K13O43283 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAP3K13O43283 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAP3K13O43283 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAP3K13O43283 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAP3K13O43283 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAP3K13O43283 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAP3K13O43283 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP3K13O43283 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP3K13O43283 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP3K13O43283 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP3K13O43283 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP3K13O43283 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAP3K13O43283 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAP3K13O43283 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAP3K13O43283 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAP3K13O43283 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAP3K13O43283 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAP3K13O43283 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAP3K13O43283 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAP3K13O43283 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAP3K13O43283 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAP3K13O43283 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAP3K13O43283 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAP3K13O43283 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms