Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC7A4O43246 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC7A4O43246 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC7A4O43246 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC7A4O43246 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC7A4O43246 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC7A4O43246 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC7A4O43246 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC7A4O43246 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC7A4O43246 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC7A4O43246 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC7A4O43246 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC7A4O43246 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC7A4O43246 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC7A4O43246 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC7A4O43246 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC7A4O43246 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC7A4O43246 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC7A4O43246 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC7A4O43246 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC7A4O43246 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC7A4O43246 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC7A4O43246 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC7A4O43246 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC7A4O43246 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC7A4O43246 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC7A4O43246 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC7A4O43246 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC7A4O43246 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC7A4O43246 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC7A4O43246 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC7A4O43246 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC7A4O43246 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC7A4O43246 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC7A4O43246 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC7A4O43246 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC7A4O43246 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC7A4O43246 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC7A4O43246 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC7A4O43246 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC7A4O43246 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC7A4O43246 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC7A4O43246 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC7A4O43246 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC7A4O43246 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC7A4O43246 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC7A4O43246 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC7A4O43246 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC7A4O43246 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC7A4O43246 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC7A4O43246 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC7A4O43246 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC7A4O43246 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC7A4O43246 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms