Protein–RNA interactions for Protein: O15269

SPTLC1, Serine palmitoyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC1O15269 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPTLC1O15269 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPTLC1O15269 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPTLC1O15269 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPTLC1O15269 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPTLC1O15269 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPTLC1O15269 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPTLC1O15269 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPTLC1O15269 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SPTLC1O15269 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SPTLC1O15269 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPTLC1O15269 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SPTLC1O15269 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPTLC1O15269 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SPTLC1O15269 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPTLC1O15269 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPTLC1O15269 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPTLC1O15269 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPTLC1O15269 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPTLC1O15269 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPTLC1O15269 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPTLC1O15269 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPTLC1O15269 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPTLC1O15269 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPTLC1O15269 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPTLC1O15269 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPTLC1O15269 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPTLC1O15269 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPTLC1O15269 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPTLC1O15269 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPTLC1O15269 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPTLC1O15269 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPTLC1O15269 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPTLC1O15269 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPTLC1O15269 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPTLC1O15269 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SPTLC1O15269 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPTLC1O15269 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPTLC1O15269 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPTLC1O15269 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPTLC1O15269 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPTLC1O15269 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPTLC1O15269 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPTLC1O15269 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPTLC1O15269 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPTLC1O15269 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPTLC1O15269 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPTLC1O15269 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPTLC1O15269 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPTLC1O15269 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPTLC1O15269 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPTLC1O15269 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPTLC1O15269 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPTLC1O15269 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPTLC1O15269 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPTLC1O15269 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPTLC1O15269 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPTLC1O15269 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPTLC1O15269 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPTLC1O15269 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPTLC1O15269 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPTLC1O15269 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPTLC1O15269 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPTLC1O15269 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPTLC1O15269 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPTLC1O15269 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPTLC1O15269 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPTLC1O15269 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPTLC1O15269 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPTLC1O15269 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPTLC1O15269 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPTLC1O15269 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPTLC1O15269 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPTLC1O15269 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPTLC1O15269 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SPTLC1O15269 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPTLC1O15269 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPTLC1O15269 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPTLC1O15269 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPTLC1O15269 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPTLC1O15269 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SPTLC1O15269 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPTLC1O15269 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPTLC1O15269 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPTLC1O15269 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPTLC1O15269 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPTLC1O15269 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SPTLC1O15269 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPTLC1O15269 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPTLC1O15269 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPTLC1O15269 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPTLC1O15269 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPTLC1O15269 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPTLC1O15269 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPTLC1O15269 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPTLC1O15269 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPTLC1O15269 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPTLC1O15269 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPTLC1O15269 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPTLC1O15269 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms