Protein–RNA interactions for Protein: O15198

SMAD9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD9O15198 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD9O15198 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD9O15198 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD9O15198 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD9O15198 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD9O15198 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD9O15198 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD9O15198 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD9O15198 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD9O15198 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD9O15198 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD9O15198 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD9O15198 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD9O15198 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD9O15198 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD9O15198 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD9O15198 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD9O15198 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD9O15198 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD9O15198 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD9O15198 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD9O15198 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD9O15198 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD9O15198 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD9O15198 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD9O15198 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD9O15198 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD9O15198 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD9O15198 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD9O15198 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD9O15198 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD9O15198 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD9O15198 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD9O15198 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD9O15198 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD9O15198 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD9O15198 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD9O15198 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD9O15198 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD9O15198 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD9O15198 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD9O15198 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD9O15198 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD9O15198 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD9O15198 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD9O15198 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD9O15198 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD9O15198 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD9O15198 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD9O15198 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD9O15198 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD9O15198 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD9O15198 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD9O15198 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD9O15198 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD9O15198 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD9O15198 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD9O15198 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD9O15198 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD9O15198 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD9O15198 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD9O15198 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD9O15198 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD9O15198 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SMAD9O15198 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD9O15198 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD9O15198 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD9O15198 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD9O15198 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD9O15198 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD9O15198 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD9O15198 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD9O15198 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD9O15198 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD9O15198 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD9O15198 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD9O15198 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD9O15198 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD9O15198 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD9O15198 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD9O15198 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD9O15198 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD9O15198 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD9O15198 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD9O15198 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD9O15198 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD9O15198 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD9O15198 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD9O15198 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD9O15198 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD9O15198 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD9O15198 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD9O15198 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD9O15198 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD9O15198 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD9O15198 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD9O15198 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD9O15198 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD9O15198 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD9O15198 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms