Protein–RNA interactions for Protein: O15164

TRIM24, Transcription intermediary factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM24O15164 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM24O15164 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM24O15164 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM24O15164 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM24O15164 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM24O15164 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM24O15164 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM24O15164 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM24O15164 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM24O15164 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM24O15164 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM24O15164 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM24O15164 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM24O15164 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM24O15164 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM24O15164 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM24O15164 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM24O15164 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM24O15164 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM24O15164 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM24O15164 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM24O15164 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM24O15164 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM24O15164 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM24O15164 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM24O15164 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM24O15164 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM24O15164 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM24O15164 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM24O15164 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM24O15164 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM24O15164 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM24O15164 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM24O15164 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM24O15164 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM24O15164 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM24O15164 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM24O15164 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM24O15164 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM24O15164 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM24O15164 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM24O15164 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM24O15164 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM24O15164 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM24O15164 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM24O15164 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM24O15164 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM24O15164 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM24O15164 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM24O15164 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM24O15164 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM24O15164 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM24O15164 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM24O15164 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM24O15164 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM24O15164 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM24O15164 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM24O15164 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms