Protein–RNA interactions for Protein: O15013

ARHGEF10, Rho guanine nucleotide exchange factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF10O15013 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ARHGEF10O15013 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ARHGEF10O15013 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ARHGEF10O15013 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ARHGEF10O15013 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ARHGEF10O15013 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ARHGEF10O15013 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ARHGEF10O15013 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ARHGEF10O15013 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
ARHGEF10O15013 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ARHGEF10O15013 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ARHGEF10O15013 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ARHGEF10O15013 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ARHGEF10O15013 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ARHGEF10O15013 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ARHGEF10O15013 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ARHGEF10O15013 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ARHGEF10O15013 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ARHGEF10O15013 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
ARHGEF10O15013 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
ARHGEF10O15013 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
ARHGEF10O15013 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
ARHGEF10O15013 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ARHGEF10O15013 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ARHGEF10O15013 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ARHGEF10O15013 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ARHGEF10O15013 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ARHGEF10O15013 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ARHGEF10O15013 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ARHGEF10O15013 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ARHGEF10O15013 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARHGEF10O15013 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARHGEF10O15013 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARHGEF10O15013 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARHGEF10O15013 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARHGEF10O15013 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARHGEF10O15013 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARHGEF10O15013 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARHGEF10O15013 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARHGEF10O15013 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ARHGEF10O15013 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ARHGEF10O15013 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ARHGEF10O15013 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ARHGEF10O15013 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ARHGEF10O15013 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ARHGEF10O15013 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ARHGEF10O15013 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ARHGEF10O15013 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ARHGEF10O15013 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ARHGEF10O15013 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ARHGEF10O15013 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ARHGEF10O15013 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ARHGEF10O15013 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARHGEF10O15013 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARHGEF10O15013 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARHGEF10O15013 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARHGEF10O15013 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARHGEF10O15013 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ARHGEF10O15013 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ARHGEF10O15013 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ARHGEF10O15013 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ARHGEF10O15013 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARHGEF10O15013 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARHGEF10O15013 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARHGEF10O15013 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ARHGEF10O15013 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ARHGEF10O15013 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ARHGEF10O15013 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ARHGEF10O15013 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
ARHGEF10O15013 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ARHGEF10O15013 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ARHGEF10O15013 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
ARHGEF10O15013 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ARHGEF10O15013 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ARHGEF10O15013 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ARHGEF10O15013 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ARHGEF10O15013 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ARHGEF10O15013 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
ARHGEF10O15013 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ARHGEF10O15013 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ARHGEF10O15013 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ARHGEF10O15013 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ARHGEF10O15013 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ARHGEF10O15013 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
ARHGEF10O15013 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ARHGEF10O15013 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ARHGEF10O15013 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ARHGEF10O15013 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ARHGEF10O15013 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ARHGEF10O15013 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
ARHGEF10O15013 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ARHGEF10O15013 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ARHGEF10O15013 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ARHGEF10O15013 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ARHGEF10O15013 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ARHGEF10O15013 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
ARHGEF10O15013 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ARHGEF10O15013 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ARHGEF10O15013 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ARHGEF10O15013 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
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