Protein–RNA interactions for Protein: O14904

WNT9A, Protein Wnt-9a, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT9AO14904 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
WNT9AO14904 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WNT9AO14904 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WNT9AO14904 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WNT9AO14904 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
WNT9AO14904 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WNT9AO14904 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
WNT9AO14904 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WNT9AO14904 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WNT9AO14904 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WNT9AO14904 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WNT9AO14904 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WNT9AO14904 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
WNT9AO14904 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WNT9AO14904 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WNT9AO14904 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WNT9AO14904 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WNT9AO14904 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WNT9AO14904 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WNT9AO14904 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WNT9AO14904 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WNT9AO14904 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
WNT9AO14904 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WNT9AO14904 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WNT9AO14904 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WNT9AO14904 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WNT9AO14904 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WNT9AO14904 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WNT9AO14904 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WNT9AO14904 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WNT9AO14904 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WNT9AO14904 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WNT9AO14904 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WNT9AO14904 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WNT9AO14904 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WNT9AO14904 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WNT9AO14904 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WNT9AO14904 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WNT9AO14904 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WNT9AO14904 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WNT9AO14904 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WNT9AO14904 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WNT9AO14904 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WNT9AO14904 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WNT9AO14904 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WNT9AO14904 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WNT9AO14904 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WNT9AO14904 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WNT9AO14904 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WNT9AO14904 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WNT9AO14904 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WNT9AO14904 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WNT9AO14904 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WNT9AO14904 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WNT9AO14904 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WNT9AO14904 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WNT9AO14904 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WNT9AO14904 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WNT9AO14904 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WNT9AO14904 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WNT9AO14904 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WNT9AO14904 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WNT9AO14904 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WNT9AO14904 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WNT9AO14904 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WNT9AO14904 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WNT9AO14904 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WNT9AO14904 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WNT9AO14904 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WNT9AO14904 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms